Bug Online

Bug

Tehnologije – GPGPU - GPGPU

Moć velikih brojeva

Projekt iz kojeg potječe maleni klijent kojeg smo spomenuli u uvodu zove se Folding at Home odnosno, u slobodnom prijevodu, "smatanje kod kuće". Zašto baš smatanje i kakve to ima veze bilo s čim? Termin smatanje iz naziva odnosi se na nastanak kompleksnih proteina iz jednostavnog lanca polipeptida koji su, pak, građeni od aminokiselina. Lanac nastaje prema kemijskoj šabloni, glasničkoj RNA (ribonukleinska kiselina) na koju transportna RNA lijepi odgovarajuće aminokiseline. Da bi lanac dobio završnu funkciju, treba se smotati u odgovarajući oblik što se događa međusobnom interakcijom aminokiselina od kojih je lanac načinjen, a koje imaju određena kemijska svojstva. Određivanje završnog 3D oblika proteina vrlo je teško, unatoč tome što je često poznat točan redoslijed aminokiselina od kojih je načinjen. Tu u cijelu priču ulazi F@H (Folding @ Home) čiji je cilj simuliranje smatanja lanaca proteina.
Obzirom da se jedan te isti lanac proteina može smotati na stotine ili tisuće milijardi različitih načina, jasno je da za simulaciju spomenutog procesa treba zaista velika računalna snaga. U slučaju F@H-a to nije procesna moć superkompjutera smještenog u podrumu nekog sveučilišta, već procesna snaga tisuće osobnih računala na koje su njihovi korisnici instalirali malenu klijentsku aplikaciju. Važno je naglasiti da F@H klijent rabi procesnu moć računala dinamički, zavisno o tome koliko korisnik opterećuje računalo s drugim aplikacijama. Drugim riječima, F@H za svoje izračune jednostavno "krade" neiskorištene resurse računala.
Iako se F@H od svog nastanka 2000. godine primarno izvodi na glavnim procesorima računala, prije dvije godine zaživjela je inicijativa iskorištavanja i performansi procesora na modernim grafičkim karticama, ali i procesnih mogućnosti koje nudi Sonyjeva igrača konzola Playstation 3. Razlog za programiranje podrške za spomenute uređaje je jednostavan – zbog svoje specifične arhitekture GPU-ovi i Cell procesor iz Playstationa 3 mogu u određenim aplikacijama imati višestruko bolje performanse od klasičnih procesora.
F@H klijenti su trenutno dostupni za operativne sustave Windows, Linux i Mac OS X te konzolu Playstation 3. Za Windowse postoji više vrsta klijenata, a to su standardni uniprocesorski klijent te SMP (za višejezgrene sisteme) i GPU klijenti visokih performansi. Samim time, na jednom je računalu istodobno moguće koristiti više klijenata odnosno istodobno iskorištavati performanse grafičke kartice ili kartica te višejezgrenih procesora. Klijenti se sistemu prijavljuju kao procesi niskog prioriteta, što će reći da troše samo slobodne resurse odnosno resurse koje nisu iskoristile druge aplikacije. Važno je naglasiti da se svi izračuni i simulacije koje su obuhvaćene projektom F@H ne mogu izvoditi na svim klijentima, pa nije preporučljivo rabiti samo jednu vrstu klijenta zato što je na prvi pogleda najbrža (primjerice GPU klijent).
Napomena: Članci iz časopisa se ne prenose uvijek kompletni, sa svim slikama, potpisima pod slike, okvirima, tablicama i sličnim. Ponekad se ne prenosi niti cijeli tekst članka. Svrha članaka na Webu jest da pruže uvid u način obrade teme i potaknu interes za proučavanjem tiskanog broja. Za cjelovit uvid u članke - savjetujemo da pogledate papirnato izdanje časopisa. Hvala.
Kako s par klikova miša učiniti nešto za dobrobit cijelog čovječanstva? Vrlo jednostavno – instalacijom malenog programčića koji će neiskorištenu snagu silicijske beštije pod vašim stolom iskoristiti za istraživanje stvaranja kompleksnih proteina. Što je najzanimljivije, za ove kompleksne izračune koristit će se ne samo vaš procesor već i grafička kartica

izdvojeni tekstovi - rujan 2008.

Mushkin Redline PC2-8000 4GB

Grimizna pamtila pon 8.9.2008

Fujifilm S100fs

Bastion kompaktnosti pet 29.8.2008

Damir Grgić

Dinosaurom do slave ned 24.8.2008

Rujan 2008.

Sjeti se ljeta... ned 24.8.2008

Nadogradnja i popravak iPoda

Nov život za stare iPode ned 24.8.2008

Telefoni s QWERTY tipkovnicom

Mobilne tipkačice ned 24.8.2008

Mobilno bankarstvo u Hrvatskoj

Šalter u džepu ned 24.8.2008

Regionalna blogosfera

Kad su b(l)ogovi vladali ned 24.8.2008

Kućni NAS

Pametna skladišta ned 24.8.2008

Stotinu PC tajni

Znanje za gurue ned 24.8.2008

Programi za fotografiju

Od sirovine do umjetnine ned 24.8.2008

Adobe Fireworks CS3

Majstor za web ned 24.8.2008

USB memorije kapaciteta 4 GB

Obračun na 4 gigabajta ned 24.8.2008

Foxconn Black Ops

Ekstremno do srži ned 24.8.2008

GPGPU

Moć velikih brojeva ned 24.8.2008

Sapphire Radeon HD 4870 X2 i 4870

Filozofija skaliranja ned 24.8.2008

Miroslav Rosandić

Malo po malo ned 24.8.2008

Bookeen CyBook Gen3

Sposoban Francuz sri 13.8.2008

Apple Time Capsule

Backupirajte - jednostavno i bežično uto 15.7.2008