Folding@home pomaže u traženju lijeka za COVID-19, svatko može pomoći

Svi koji imaju računalo i spremni su donirati ponešto procesorskog vremena mogu se uključiti u simuliranje rada proteina koronavirusa SARS-CoV-2

Sandro Vrbanus subota, 21. ožujka 2020. u 18:30

Folding@home neprofitni je projekt nastao na kemijskom odjelu sveučilišta Stanford. Slično kao i nedavno ugašeni SETI@Home, koristi se "posuđenim" procesorskim vremenom koje mu doniraju volonteri diljem svijeta. No, umjesto da traga za izvanzemaljskim životom ovaj se crowdsourceani projekt bavi proučavanjem i simuliranjem rada proteina.

Proteini su zapravo maleni molekularni strojevi koji mogu imati različite funkcije u živim stanicama, a kao takvi ključni su i za širenje, ali i sprječavanje širenja zaraze virusima. Sastavljeni su od aminokiselina, dugih nizova molekula koje se ponekad sklapaju (fold) u funkcionalne strukture. Ti procesi događaju se na razini atoma i molekula i prilično ih je zahtjevno proučavati. Stoga se Folding@home koristi velikom mrežom volontera i njihovih računala kako bi simulirao ponašanje atoma u procesu "foldanja".

Foldingom na koronu

Otkrivanje načina kako mehanizmi u tom procesu funkcioniraju može pomoći u otkrivanju lijekova koji bi spriječili djelovanje proteina u virusima, pa tako i kod virusa 2019-nCoV, poznatog kao koronavirus. To su uvidjeli i u Stanfordu pa su prioritet u svojem projektu stavili upravo na projekt COVID-19.

Cilj simulacije jest utvrditi kako koronavirus SARS-CoV-2 i njegovi proteini dolaze u interakciju s receptorom ACE2 na ljudskim stanicama te posljedično aktiviraju mehanizam ulaska virusa u stanice. Poznavanje detalja ovog procesa istraživačima bi trebalo pomoći u izradi novih antitijela, odnosno molekula koje bi taj proces bile u stanju presresti i zaustaviti.

Bugovi forumaši također pomažu

Svi koji žele posuditi ponešto svoje računalne snage mogu na stranicama projekta Folding@home skinuti njihov softver i uključiti se u rad. Ovih dana su Intel i Nvidia pozvali sve gamere i vlasnike njihovih CPU-ova i GPU-ova da procesorsku snagu doniraju ovom projektu kako bi se povećale šanse za dobivanje bitke protiv koronavirusa.

Otkako je izbila pandemija koronavirusa u projektu Folding@home sudjelovalo je oko 30 tisuća volontera sa svojim računalima, taj broj je vrlo brzo narastao, pa ih je trenutačno preko 400.000.

Spomenimo ovom prigodom i da je tim Bugovih forumaša Cro4Life aktivno uključen u ovaj projekt već godinama. Trenutačno se nalaze na 541. mjestu najaktivnijih timova u svijetu (od ukupno njih 6 tisuća). Iako imamo malen broj aktivnih foldera, aktivnost im je u posljednjim danima povećana – čestitamo!

Kako im se priključiti?

Nakon preuzimanja i instaliranja programa potrebno je zatražiti passkey. Nakon početka foldanja u postavkama upisati broj tima Cro4Life (137516)

Savjeti:

Foldati se može i s GPU i s CPU, čak i istodobno. Iako su bodovi za GPU poprilično veći, CPU klijenti su neophodni jer se na njima obrađuju stvari koje GPU nije u stanju obraditi. Korisnici novih Navi kartica moraju koristiti opciju "client-type: advanced" jer u protivnom neće dobiti nikakav work unit za rad.

Zbog povećanog interesa za foldanje može se dogoditi I da nekoliko sati ne dobijete novi work unit – to je dobra stvar jer znaci da mreža podatke obrađuje podatke brže nego je potrebno.

Dolje desno se vidi koliko je preostalo do iduće provjere (Next Attempt)
Dolje desno se vidi koliko je preostalo do iduće provjere (Next Attempt)
Napomena: u slučaju izostanka slobodnih WU pauza između provjera će biti sve veća i veća, sve do nekoliko sati pauze između provjera. U tom slučaju foldanje se može pauzirati, a tada će se timer za provjeru resetirati i ponovo provjeriti postoje li raspoloživi work uniti za download. BITNO: Ne spamati sa ovom opcijom jer su F@H I ovako pod velikim opterećenjem. Tek ako nema ništa sat-dva onda je preporučljivo napraviti taj korak.
Napomena: u slučaju izostanka slobodnih WU pauza između provjera će biti sve veća i veća, sve do nekoliko sati pauze između provjera. U tom slučaju foldanje se može pauzirati, a tada će se timer za provjeru resetirati i ponovo provjeriti postoje li raspoloživi work uniti za download. BITNO: Ne spamati sa ovom opcijom jer su F@H I ovako pod velikim opterećenjem. Tek ako nema ništa sat-dva onda je preporučljivo napraviti taj korak.


Ronis Hi-Fi slušaonica na Velesajmu.

Rezervirajte svoj termin!

Želite doživjeti zvuk visoke kvalitete? Pridružite nam se u našoj Hi-Fi slušaoni Ronis Velesajam i iskusite zvuk najpoznatijih svjetskih Hi-Fi brendova.

Kupi

Simpatični par floorstandera sa solidnim basom.

Zvučnici ACOUSTIC ENERGY AE309 walnut (par)

2.5-sistemski zvucnici sa 130mm mid-bass jedinicama i 28mm aluminijskim visokotoncem, frekvencijski raspon 38Hz -30kHz, osjetljivost 89dB, vršni SBL 115dB, snaga 175W, crossover frekvencija 296Hz / 2.56kHz, impedancija 6 ohma.

1.349 € 1.499 € Akcija

Savršeno se uklapa u Sonos Home Sound System.

Bežični Hi-Fi zvučnik SONOS One Gen.2

Pametni zvučnik sa glasovnom kontrolom Google Assistant i Amazon Alexa. Bežično povezivanje sa Sonos Home Sound System zvučnicima za reprodukciju glazbe u svakoj sobi. Mat finiš, izdržljivi metalni grill, kontrole na dodir, otporan na vlagu. Wi-Fi. Airplay 2.

219 € 249 € Akcija

Prikladni za sobe male i srednje veličine.

Zvučnici ACOUSTIC ENERGY AE300 (par)

Slijedom nagradivanog AE100, nudi znacajan napredak u audio kvaliteti, materijalima i završnoj izvedbi. 2-sistemski zvucnici sa 130mm mid-bass jedinicama drivera, novim keramickim aluminijskim sandwich konusom i 28mm aluminijskim visokotoncem

764 € 849 € Akcija

Glazba s bilo kojeg uređaja ili aplikacije.

Bežični Hi-Fi zvučnici AUDIOENGINE HD4

HD4 kucni glazbeni sustav s Bluetooth aptX-HD. HD4 se može povezati žicano ili bežicno, tako da možete reproducirati svoju glazbu s racunala, telefona, tableta, cak i sa gramofona ili kazetofona.

399 € 549 € Akcija

Legendarni Marshall zvuk.

Prijenosni zvučnik MARSHALL Willen black&brass

Ovaj zvucnik vam donosi Marshall zvuk koji volite s jednim 2" full ranger driverom i dva pasivna radijatora. Savršen je za vanjsku upotrebu sa svojom IP67 ocjenom otpornosti na prašinu i vodu. Willen spaja kultni Marshall dizajn s robusnošcu koja vas izaziva da pomaknete njezine granice

90,50 € 115,00 € Akcija

Potpuno i sveobuhvatno uživanje u glazbi.

Stereo / Mrežni Receiver YAMAHA R-N800A

Yamaha R-N800A je HiFi prijemnik s vrhunskim zvukom i modernim dizajnom. Ima YPAO™ tehnologiju za podešavanje zvuka u prostoriji, MusicCast streaming, USB DAC, phono input, Enthernet, Headphone out. MP3, WMA, MPEG-4 AAC, WAV, FLAC, AIFF, DSD, AirPlay.

1.089 € Akcija

Slim i praktičan AV receiver.

AV receiver MARANTZ NR1510

Tanki 5.2-kanalni Ultra HD AV receiver sa ugradenom HEOS tehnologijom, snaga 50W po kanalu (8 ohma), 6 HDMI ulaza sa punom HDCP 2.3 podrškom, podrška za Dolby Vision, Hybrid Log-Gamma, eARC i ALLM, 4K/60 Hz full-rate pass-through, 24-bit/192-kHz, Wi-Fi.

539 € Kupi

Hibridno digitalno DAC pojačalo.

Digitalno pojačalo NAD C 338

D/A konverter, kontinuiranih 2 x 50W na 8 ili 4 Ohma, Hybrid Digital Amplification tehnologija,2 x opticki i 2 x koaksijalni digitalni ulazi, 2 x Analogni ulazi, Phono ulaz, subwoofer izlaz,Wi-Fi s mogucnošcu streaminga glazbenih servisa, internet radio, UPnP protokol,bluetooth ADP4 sa aptX

749 € Kupi

Ručno sastavljeni u britanskom Oxfordu.

Zvučnici FALCON ACOUSTICS LS3/5A Gold Badge cherry

Zvučnici Falcon Acoustic BBC LS3/5a, dvostazni standmount, bas-mid: Falcon B-110, bextrene 127 mm, visoki: Falcon T-27, mylar, 19 mm, zatvorena kutija, frekvencijski raspon 70 Hz – 20 kHz, osjetljivost 83 dB, impedancija 15 Ohma.

2.760 € 3.450 € Akcija

Gen2 Obsidian Folded Motion® visokotonac XT

Zvučnici MARTIN LOGAN Motion XT F100 White

Doživite iznimnu kvalitetu zvuka s MartinLoganovim Gen2 Folded Motion® XT visokotoncem koji sadrži tehnologiju Folded Motion® Waveguide neprimjetno integriranu u elegantan dizajn prednje pregrade.

6.209 € NOVO