Folding@home pomaže u traženju lijeka za COVID-19, svatko može pomoći
Svi koji imaju računalo i spremni su donirati ponešto procesorskog vremena mogu se uključiti u simuliranje rada proteina koronavirusa SARS-CoV-2

Folding@home neprofitni je projekt nastao na kemijskom odjelu sveučilišta Stanford. Slično kao i nedavno ugašeni SETI@Home, koristi se "posuđenim" procesorskim vremenom koje mu doniraju volonteri diljem svijeta. No, umjesto da traga za izvanzemaljskim životom ovaj se crowdsourceani projekt bavi proučavanjem i simuliranjem rada proteina.
Proteini su zapravo maleni molekularni strojevi koji mogu imati različite funkcije u živim stanicama, a kao takvi ključni su i za širenje, ali i sprječavanje širenja zaraze virusima. Sastavljeni su od aminokiselina, dugih nizova molekula koje se ponekad sklapaju (fold) u funkcionalne strukture. Ti procesi događaju se na razini atoma i molekula i prilično ih je zahtjevno proučavati. Stoga se Folding@home koristi velikom mrežom volontera i njihovih računala kako bi simulirao ponašanje atoma u procesu "foldanja".
Foldingom na koronu
Otkrivanje načina kako mehanizmi u tom procesu funkcioniraju može pomoći u otkrivanju lijekova koji bi spriječili djelovanje proteina u virusima, pa tako i kod virusa 2019-nCoV, poznatog kao koronavirus. To su uvidjeli i u Stanfordu pa su prioritet u svojem projektu stavili upravo na projekt COVID-19.
Cilj simulacije jest utvrditi kako koronavirus SARS-CoV-2 i njegovi proteini dolaze u interakciju s receptorom ACE2 na ljudskim stanicama te posljedično aktiviraju mehanizam ulaska virusa u stanice. Poznavanje detalja ovog procesa istraživačima bi trebalo pomoći u izradi novih antitijela, odnosno molekula koje bi taj proces bile u stanju presresti i zaustaviti.
Bugovi forumaši također pomažu
Svi koji žele posuditi ponešto svoje računalne snage mogu na stranicama projekta Folding@home skinuti njihov softver i uključiti se u rad. Ovih dana su Intel i Nvidia pozvali sve gamere i vlasnike njihovih CPU-ova i GPU-ova da procesorsku snagu doniraju ovom projektu kako bi se povećale šanse za dobivanje bitke protiv koronavirusa.
Otkako je izbila pandemija koronavirusa u projektu Folding@home sudjelovalo je oko 30 tisuća volontera sa svojim računalima, taj broj je vrlo brzo narastao, pa ih je trenutačno preko 400.000.
Spomenimo ovom prigodom i da je tim Bugovih forumaša Cro4Life aktivno uključen u ovaj projekt već godinama. Trenutačno se nalaze na 541. mjestu najaktivnijih timova u svijetu (od ukupno njih 6 tisuća). Iako imamo malen broj aktivnih foldera, aktivnost im je u posljednjim danima povećana – čestitamo!
Kako im se priključiti?
Nakon preuzimanja i instaliranja programa potrebno je zatražiti passkey. Nakon početka foldanja u postavkama upisati broj tima Cro4Life (137516)
Savjeti:
Foldati se može i s GPU i s CPU, čak i istodobno. Iako su bodovi za GPU poprilično veći, CPU klijenti su neophodni jer se na njima obrađuju stvari koje GPU nije u stanju obraditi. Korisnici novih Navi kartica moraju koristiti opciju "client-type: advanced" jer u protivnom neće dobiti nikakav work unit za rad.
Zbog povećanog interesa za foldanje može se dogoditi I da nekoliko sati ne dobijete novi work unit – to je dobra stvar jer znaci da mreža podatke obrađuje podatke brže nego je potrebno.