Biobot: analiza fekalija za praćenje epidemije koronavirusa

Nestašica dijagnostičkih testova za SARS-CoV-2 inicirala je pokretanje startupa koji nudi rješenje za praćenje širenja koronavirusne infekcije u urbanim područjima pretraživanjem sadržaja gradske kanalizacije

Igor Berecki ponedjeljak, 23. ožujka 2020. u 06:30

Biobot, jedna od spinoff tvrtki MIT-a (Instituta za tehnologiju u Massachusettsu), predlaže da se  mapiranje širenja pandemije izazvane koronavirusom SARS-CoV-2 vrši analizom podataka dobivenih iz uzoraka fekalnog otpada iz kanalizacijskih sustava prikupljenih iz cijelog SAD-a.

Ideja za projekt je nastala iz rezultata novijih istraživanja širenja zaraze, koja su pokazala da se SARS-CoV-2, virus koji uzrokuje COVID-19 (wuhansku bolest), osim putem sluznice dišnog sustava (kašljanja, kihanja), može iz zaraženih osoba širiti i putem njihovih fekalija.

Jedna dobra... i još jedna dobra vijest

Prva dobra vijest je što i za ovakav način širenja infekcije vrijedi pravilo da je često i temeljito pranje ruku najučinkovitija mjera za sprečavanje rasapa virusa u okolinu.

A druga dobra vijest je da u uvjetima normalnih sanitacijskih sustava kakvi postoje u praktički svim gradskim naseljima naše fekalije eliminiramo u kanalizacijske sustave. Jer, Biobot želi testirati sadržaj te kanalizacije na SARS-CoV-2, a zatim pomoću dobivenih podataka mapirati prisutnost virusa u urbanim područjima i slijediti smjerove njegovog širenja.

Digitalizirana mapa gradskog kanalizacijskog sustava (centar Philadelphije)
Digitalizirana mapa gradskog kanalizacijskog sustava (centar Philadelphije)

Kanalizacijske mape će omogućiti gradskim epidemiološkim službama procjenu opsega epidemije bez oslanjanja na rezultate testiranja sluznice dišnih puteva oboljelih osoba i bez korištenja bolničkih laboratorijskih resursa, čak i kod inficiranih pacijenata koji još nemaju vidljive kliničke simptome. "COVID-19, baš kao i neke druge virusne bolesti, uzrokuje da inficirani ljudi izlučuju viruse dišnom sluznicom i fekalijama i danima prije nego što imaju simptome, što pak znači da kanalizacija može biti rani pokazatelj širenja bolesti – puno prije nego što ti ljudi zatraže medicinsku skrb", napisali su suosnivači Biobota Mariana Matus i Newsha Ghaeli u svojem blogu.

Podaci o regionalnoj proširenosti virusa u kanalizaciji mogu biti korisni pri određivanju i uvođenju javnozdravstvenih mjerama od strane gradskih vlasti, mogu predvidjeti stupanj buduće opterećenosti lokalnih bolnice epidemijom, a mogu služiti i za praćenje učinkovitosti epidemioloških intervencija. Pokaže li se da koronavirus ima sezonski ciklus, analiza kanalizacije bi čak mogla i poslužiti za rano upozorenje da će se epidemija ubrzo ponovno pojaviti.

Od opijata do izmeta

Biobotov tim biologa, epidemiologa, stručnjaka za obradu podataka, urbanista i inženjera je ovu tehnologiju već koristio tijekom nedavnog američkog projekta praćenja porasta korisnika opioidnih sredstava ovisnosti. Tada su mjerenjem prisutnosti opioidnih molekula u gradskoj kanalizaciji i korištenjem tih podataka za mapiranje kanalizacijskog sustava pomogli gradskim vlastima i saveznoj policiji da preciznije locira gradska područja u kojima je povećan broj ovisnika. Naime, metabolički produkti opijata mogu se i u mikronskim količinama detektirati u urinu ovisnika, pa tako i u kanalizacijskim vodama koje dolaze iz njihovih sanitarnih čvorova.

Postrojenja za tretman otpadnih voda: početne točke prikupljanja fekalija za daljnju laboratorijsku analizu
Postrojenja za tretman otpadnih voda: početne točke prikupljanja fekalija za daljnju laboratorijsku analizu

Stoga, čim su znanstvenici koji se bave istraživanjem kliničkih karakteristika SARS-CoV-2 virusa dokazali da se virus može naći u uzorcima fekalija, Biobot je odmah svoj fokus usmjerio na analizu koronavirusne epidemije. Tehnologija i operativna infrastruktura je identična kao za praćenje opijata u kanalizaciji, samo se mijenja završni korak - spojevi koji se detektiraju procesima laboratorijske analize kanalizacijske vode. Umjesto opijatskih metabolita, sada se traže laboratorijski markeri virusnih nukleinskih kiselina.

Kako bi dobio podatke o prisutnosti virusa, Biobot će komplete za uzorkovanje isporučiti u gradska postrojenja za otpadne vode, iz kojih će se uzorke slati u Biobotove laboratorije, a tamo će ih znanstvenici testirati kako bi otkrili prisustvo ili odsustvo virusa. Rezultati će se zatim računalno „ucrtavati“ na kanalizacijske mape gradova, te poslati lokalnim epidemiološkim i komunalnim službama koje te podatke mogu koristiti u svojim strategijama za borbu protiv pandemije.

Biobot je javno pozvao sve relevantne subjekte zdravstvenih i epidemioloških službi, postrojenja za otpadne vode i predstavnike lokalnih vlasti koji žele da se njihov grad uključi u suradnju s tvrtkom da se jave i zajednički krenu u ozbiljno proučavanje gradskih fekalija.

 

 

Igor „Doc“ Berecki je pedijatar-intenzivist na Odjelu intenzivnog liječenja djece Klinike za pedijatriju KBC Osijek. Od posla se opušta antistresnim aktivnostima: od pisanja svojevremeno popularnih tekstova i ilustracija u tiskanom izdanju časopisa BUG, crtkanja grafika i dizajna, zbrinjavanja pasa i mačaka, te fejsbučkog blogiranja o craft-pivima, životnim neistinama i medicinskim trivijama, sve do pasioniranog kuhanja posve probavljivih jela i sviranja slabo probavljivog bluesa.

Najmanji i najtanji 14" gaming prijenosnik s AMD Ryzen

165 Hz

RAZER Blade 14

Ryzen 9 5900HX, 16GB, 1000GB SSD, GeForce RTX 3070 8GB, 14" QHD 165Hz, Windows 10

17.499 kn 18.799 kn Kupi


Bežični HiFi zvučnici

AUDIOENGINE A2BT

Premium aktivni zvučnici sa stereo zvukom visoke vjernosti spajaju se sa vašom glazbom sa bilo koje aplikacije ili uređaja u sekundi. Vrhunski Bluetooth mini kućni glazbeni sustav savršen je za radnu površinu ili manje prostore.

1299 2289 Kupi

Prijenosni zvučnik

JBL GO 2 champagne

Prijenosni Bluetooth zvučnik za bežični streaming glazbe sa pametnog telefona ili tableta sa ugrađenom punjivom baterijom za do 5 sati reprodukcije, vodootpornim dizajnom i ugrađenim mikrofonom. Dolazi sa audio kabelom.

189 279 Kupi