Biobot: analiza fekalija za praćenje epidemije koronavirusa
Nestašica dijagnostičkih testova za SARS-CoV-2 inicirala je pokretanje startupa koji nudi rješenje za praćenje širenja koronavirusne infekcije u urbanim područjima pretraživanjem sadržaja gradske kanalizacije

Biobot, jedna od spinoff tvrtki MIT-a (Instituta za tehnologiju u Massachusettsu), predlaže da se mapiranje širenja pandemije izazvane koronavirusom SARS-CoV-2 vrši analizom podataka dobivenih iz uzoraka fekalnog otpada iz kanalizacijskih sustava prikupljenih iz cijelog SAD-a.
Ideja za projekt je nastala iz rezultata novijih istraživanja širenja zaraze, koja su pokazala da se SARS-CoV-2, virus koji uzrokuje COVID-19 (wuhansku bolest), osim putem sluznice dišnog sustava (kašljanja, kihanja), može iz zaraženih osoba širiti i putem njihovih fekalija.
Jedna dobra... i još jedna dobra vijest
Prva dobra vijest je što i za ovakav način širenja infekcije vrijedi pravilo da je često i temeljito pranje ruku najučinkovitija mjera za sprečavanje rasapa virusa u okolinu.
A druga dobra vijest je da u uvjetima normalnih sanitacijskih sustava kakvi postoje u praktički svim gradskim naseljima naše fekalije eliminiramo u kanalizacijske sustave. Jer, Biobot želi testirati sadržaj te kanalizacije na SARS-CoV-2, a zatim pomoću dobivenih podataka mapirati prisutnost virusa u urbanim područjima i slijediti smjerove njegovog širenja.
Kanalizacijske mape će omogućiti gradskim epidemiološkim službama procjenu opsega epidemije bez oslanjanja na rezultate testiranja sluznice dišnih puteva oboljelih osoba i bez korištenja bolničkih laboratorijskih resursa, čak i kod inficiranih pacijenata koji još nemaju vidljive kliničke simptome. "COVID-19, baš kao i neke druge virusne bolesti, uzrokuje da inficirani ljudi izlučuju viruse dišnom sluznicom i fekalijama i danima prije nego što imaju simptome, što pak znači da kanalizacija može biti rani pokazatelj širenja bolesti – puno prije nego što ti ljudi zatraže medicinsku skrb", napisali su suosnivači Biobota Mariana Matus i Newsha Ghaeli u svojem blogu.
Podaci o regionalnoj proširenosti virusa u kanalizaciji mogu biti korisni pri određivanju i uvođenju javnozdravstvenih mjerama od strane gradskih vlasti, mogu predvidjeti stupanj buduće opterećenosti lokalnih bolnice epidemijom, a mogu služiti i za praćenje učinkovitosti epidemioloških intervencija. Pokaže li se da koronavirus ima sezonski ciklus, analiza kanalizacije bi čak mogla i poslužiti za rano upozorenje da će se epidemija ubrzo ponovno pojaviti.
Od opijata do izmeta
Biobotov tim biologa, epidemiologa, stručnjaka za obradu podataka, urbanista i inženjera je ovu tehnologiju već koristio tijekom nedavnog američkog projekta praćenja porasta korisnika opioidnih sredstava ovisnosti. Tada su mjerenjem prisutnosti opioidnih molekula u gradskoj kanalizaciji i korištenjem tih podataka za mapiranje kanalizacijskog sustava pomogli gradskim vlastima i saveznoj policiji da preciznije locira gradska područja u kojima je povećan broj ovisnika. Naime, metabolički produkti opijata mogu se i u mikronskim količinama detektirati u urinu ovisnika, pa tako i u kanalizacijskim vodama koje dolaze iz njihovih sanitarnih čvorova.
Stoga, čim su znanstvenici koji se bave istraživanjem kliničkih karakteristika SARS-CoV-2 virusa dokazali da se virus može naći u uzorcima fekalija, Biobot je odmah svoj fokus usmjerio na analizu koronavirusne epidemije. Tehnologija i operativna infrastruktura je identična kao za praćenje opijata u kanalizaciji, samo se mijenja završni korak - spojevi koji se detektiraju procesima laboratorijske analize kanalizacijske vode. Umjesto opijatskih metabolita, sada se traže laboratorijski markeri virusnih nukleinskih kiselina.
Kako bi dobio podatke o prisutnosti virusa, Biobot će komplete za uzorkovanje isporučiti u gradska postrojenja za otpadne vode, iz kojih će se uzorke slati u Biobotove laboratorije, a tamo će ih znanstvenici testirati kako bi otkrili prisustvo ili odsustvo virusa. Rezultati će se zatim računalno „ucrtavati“ na kanalizacijske mape gradova, te poslati lokalnim epidemiološkim i komunalnim službama koje te podatke mogu koristiti u svojim strategijama za borbu protiv pandemije.
Biobot je javno pozvao sve relevantne subjekte zdravstvenih i epidemioloških službi, postrojenja za otpadne vode i predstavnike lokalnih vlasti koji žele da se njihov grad uključi u suradnju s tvrtkom da se jave i zajednički krenu u ozbiljno proučavanje gradskih fekalija.
Igor „Doc“ Berecki je pedijatar-intenzivist na Odjelu intenzivnog liječenja djece Klinike za pedijatriju KBC Osijek. Od posla se opušta antistresnim aktivnostima: od pisanja svojevremeno popularnih tekstova i ilustracija u tiskanom izdanju časopisa BUG, crtkanja grafika i dizajna, zbrinjavanja pasa i mačaka, te fejsbučkog blogiranja o craft-pivima, životnim neistinama i medicinskim trivijama, sve do pasioniranog kuhanja posve probavljivih jela i sviranja slabo probavljivog bluesa.